Reprenant les principes de gameplay des deux titres, le système des Infinty Gem vu dans Marvel Super Heroes et le Duo Team Attack (2 vs 2) de Marvel vs Capcom : Clash of Super Heroes, la compilation passera sous le bistouri du toubib pour un lifting HD et offrira de nouveaux défis à remplir. La possibilité sera aussi offerte de jouer en ligne avec lobbies de 8 joueurs, avec un mode spectateur et un système de sauvegarde des replays.